| Atleta | País | Resultado | Notas |
|---|---|---|---|
| Nathan Adrian | Estados Unidos | 47.97 | Q |
| Hanser Garcia | Cuba | 48.04 | Q |
| Sebastiaan Verschuren | Holanda | 48.13 | Q |
| Brent Hayden | Canadá | 48.21 | Q |
| Yannick Agnel | França | 48.23 | Q |
| Konrad Czerniak | Polónia | 48.44 | |
| Pieter Timmers | Bélgica | 48.57 | |
| Cullen Jones | Estados Unidos | 48.60 |
| Atleta | País | Resultado | Notas |
|---|---|---|---|
| James Magnussen | Austrália | 47.63 | Q |
| César Cielo | Brasil | 48.17 | Q |
| Nikita Lobintsev | Rússia | 48.38 | Q |
| Gideon Louw | África do Sul | 48.44 | |
| Fabien Gilot | França | 48.49 | |
| James Roberts | Austrália | 48.57 | |
| Brett Fraser | Ilhas Caimãs | 48.92 | |
| Shaune Fraser | Ilhas Caimãs | 49.07 |
| Q | Qualificação Directa |
|---|---|
| q | Qualificação por repescagem |
| DNS | Não competiu |
| DNF | Não terminou |
| DSQ | Desclassificado |
| PB | Melhor marca pessoal |
| SB | Melhor marca pessoal na temporada |
| NR | Recorde nacional |
| CR | Recorde continental |
| WR | Recorde mundial |
| OR | Recorde olímpico |